آنالیز بیوانفورماتیکی حساسیت زایی پروتئینهای جدید در موجودات تراریخته

نویسندگان

نجف الهیاری فرد

najaf allahyari fard زرین مینوچهر

zarrin minuchehr امیر موسوی

amir mousavi

چکیده

موجودات تراریخته اهمیت، کاربرد و گستره وسیعی در زیست فناوری دارند. گیاهان تراریخته در دهه اخیر به منظور تولید مواد غذایی و مصارف صنعتی رشد و توسعه قابل توجهی داشته اند. چراکه استفاده از گیاهان و محصولات تراریخته با توجه به محدودیتهای افزایش سطح زیر کشت، راه حلی کلیدی پاسخ به تقاضای روزافزون غذا در جهان است. از اینرو ایمنی مصرف محصولات تراریخته یکی از ضروریات مهم به شمار می رود. یکی از مهم ترین موارد ایمنی، اطمینان از حساسیت زا نبودن (غیر آلرژن) پروتئین های جدید در موجودات تراریخته است. آلرژی و آلرژن ها حدود یک سوم جمعیت جهان را تحت تاثیر قرار داده اند. آلرژن پروتئین یا گلیکوپروتئینی است که بوسیله سیستم ایمنی افراد دارای حساسیت شناسایی می شود. تا کنون حدود 1600 آلرژن شناسایی شده اند. آنالیزهای بیوانفورماتیکی یکی از ابزارهای کارآمد و اولیه برای تعیین آلرژنیسیته پروتئین های جدید به شمار می آیند. این کار بوسیله پایگاه های اطلاعاتی آلرژن ها با قابلیت جستجو و محاسبه میزان مشابهت توالی پروتئین جدید با پروتئینهای آلرژن قبلی صورت می گیرد. براساس مقررات بین المللی این محاسبه مشابهت در سه سطح توالی کامل، توالی 80 اسیدآمینه ای (دامنه) و توالی 6 تا 8 اسیدآمینه ای انجام می شود. درجه تاثیر و سودمندی آنالیزهای بیوانفورماتیکی آلرژنیسیته موجودات تراریخته جدید، ارتباط مستقیمی با ماهیت و محتوای پایگاه های اطلاعاتی دارد که در تحلیل از آن استفاده می شود. اخیرا تعداد پایگاه های اطلاعاتی آلرژن ها افزایش یافته اند و هر کدام نیازهای خاصی را برآورده می سازند. این پایگاه های اطلاعاتی در حجم داده ها، سازماندهی و قابلیت ها تفاوت دارند. در این مقاله ضمن معرفی اجمالی پایگاه های اطلاعاتی حاوی آلرژن ها، شامل iuis ، allallergy، afds، a allergome، informall، allergopharma، sdap، evaller،allerdb ، biopep آنالیز بیوانفورماتیکی توالی های پروتئینی به منظور بررسی آلرژنیسیته با استفاده از این پایگاه ها نیز تبیین گردیده است.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

آنالیز بیوانفورماتیکی فاکتور رونویسی MADS-box در گیاه Brachypodium distachyon

آغاز گلدهی فاکتور مهمی است که عملکرد گیاه را تحت تأثیر قرار می‌دهد. عوامل محیطی تأثیر معنی‌داری بر مرحله گلدهی می‌گذارند. آنالیز بیوانفورماتیک فاکتور رونویسی MADS-box که به عنوان اجزای مهم در تشکیل گلدهی انجام گرفت. برکپودیوم گیاه مدل جدیدی است که برای درک بهتر مکانیسم‌های ژنتیکی، سلولی و بیولوژی مولکولی گیاهان مورد استفاده قرار می‌گیرد. در این مطالعه 43 توالی ژن‌های MADS-box برکپودیوم با استفا...

متن کامل

آنالیز بیوانفورماتیکی فاکتور رونویسی MADS-box در گیاه Brachypodium distachyon

آغاز گلدهی فاکتور مهمی است که عملکرد گیاه را تحت تأثیر قرار می‌دهد. عوامل محیطی تأثیر معنی‌داری بر مرحله گلدهی می‌گذارند. آنالیز بیوانفورماتیک فاکتور رونویسی MADS-box که به عنوان اجزای مهم در تشکیل گلدهی انجام گرفت. برکپودیوم گیاه مدل جدیدی است که برای درک بهتر مکانیسم‌های ژنتیکی، سلولی و بیولوژی مولکولی گیاهان مورد استفاده قرار می‌گیرد. در این مطالعه 43 توالی ژن‌های MADS-box برکپودیوم با استفا...

متن کامل

طراحی الگویی جهت حساسیت زایی اطلاعات حسابداری مدیریت در مدیران

اطلاعات حسابداری مدیریت می‌تواند پشتیبانی لازم را از تصمیم‌گیری‌های مدیران به عمل آورد و این تصمیم‌گیری‌ها را مؤثرتر و کاراتر سازد. اطلاعات حسابداری مدیریت می‌تواند از طریق فراهم نمودن ورودی اساسی برای ایجاد حساسیت در مدیران سازمان‌ها، نقش توانمندسازی را ایفا نماید. این تحقیق به طراحی الگویی جهت حساسیت‌زایی در مدیران نسبت به اطلاعات حسابداری مدیریت با به‌کارگیری تئوری زمینه بنیان می‌پردازد و به...

متن کامل

آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش‌بینی میکرو RNA های بالقوه مهارکننده فرایندهای رگزایی در سرطان

زمینه و هدف : با افزایش اندازه تومور، محیط سلول‏های توموری هیپوکسیک و اسیدیک شده و سلول‌ها شروع به افزایش تولید چندین نوع عامل رشد می‏کنند که در نتیجه آن تشکیل رگ‏های خونی موضعی آغاز می‏شود. به دنبال آن متاستاز سلول‌های سرطانی از طریق عروق خونی اتفاق می‌افتد، لذا مهار رگزایی می‌تواند روش جدیدی برای درمان سرطان باشد. این مطالعه به منظور آنالیز بیوانفورماتیکی برای پیش‌بینی میکرو RNA های بالقوه مه...

متن کامل

آنالیز حساسیت فرایند گرمایش تشعشی ( از کف ) در ساختمان

در این مقاله اثر پارامترهای مختلف را بر روی زمان گرم شدن یک اتاق بر اثر گرمایش کفی از طریق حل زمانی معادلات انتقال حرارت با در نظر گرفتن مکانیزم های هدایت ، جابجایی و تشعشع در سه نقطه کف ، وسط و بالای اتاق به کمک مدل سازی اجزا محدود و حل مساله انتقال حرارت به کمک نرم افزار ANSYS انجام شده است . در مدل در نظر گرفته شده حرارت از لوله های آب به کمک مکانیزم هدایت به سطح منتقل می شود و انتقال حرار...

متن کامل

آنالیز بیوانفورماتیکی پروتئین مایکوباکتریایی Rv1733c بعنوان کاندیدای واکسن، همسانه سازی و بیان آن در Escherichia coli

از آنجا که تعداد زیادی از جمعیت جهان به صورت نهفته با باسیل سل (Mycobacterium tuberculosis) آلوده هستند، واکسن هایی که سل نهفته را مورد هدف قرار بدهند تاثیر قابل توجهی در کنترل شیوع جهانی سل خواهند داشت. در این پژوهش ابتدا آنالیزهای بیوانفورماتیک روی یک پروتئین مایکوباکتریایی مربوط به فاز نهفته عفونت به نام Rv1733c انجام شد و پیش بینی شد که Rv1733c یک پروتئین غشایی با تعداد زیادی اپیتوپ های سلو...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
genetics in the 3rd millennium

جلد ۱۰، شماره ۳، صفحات ۲۸۴۶-۲۸۵۵

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023